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XL01126抑制剂

  XL01126 是一种强效的 LRRK2 降解剂,DC50 分别为 14 nM (G2019S LRRK2) 和 32 nM (WT LRRK2)。XL01126 可透过血脑屏障,并作为降解探针,用于帕金森疾病的研究。XL01126 能在 LRRK2 的非催化和框架功能的研究中发挥作用。
 
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  为大家推荐一篇发表在J. Am. Chem. Soc.上的文章,文章的通讯作者是来自英国邓迪大学的Alessio Ciulli和Dario R. Alessi,前者做的是靶向蛋白降解方面的研究,后者做的是LRRK2信号通路相关的研究。
 
  首先,作者以一种可穿透血脑屏障的抑制剂HG-10-012-01为LRRK2原型配体,E3配体部分则选择了CRBN、cIAP和VHL的配体,将两部分通过linker连接后构建了第一代化合物库。通过WB检测LRRK2及其底物Rab10的Thr73磷酸化水平来评估抑制效果,作者初步筛选出了3种具有较好抑制作用的分子,发现它们的E3配体部分都是VHL配体。于是,作者以LRRK2配体、VHL配体和linker这3个模块为基础进行衍生与组合,得到了第二代化合物库。在针对第二代化合物库的筛选中,作者发现了2种活性非常高的化合物XL01126和XL01134,它们在33 nM下处理24 h就可以实现对LRRK2超过50%的降解,而时间依赖性降解实验又显示XL01126具有更快的降解速率。因此,作者确定了XL01126为最终的PROTAC分子。
 
  对于PROTAC分子而言,该分子与靶蛋白和E3连接酶间三元复合的亲和力、协同性和稳定性是至关重要的。作者设计了一个BRET实验来表征各PROTAC分子诱导三元复合物的形成,结果表明XL01126拥有最高的复合物诱导能力,其协同性显著大于XL01134。随后,为了验证该分子的靶向性,作者对XL01126处理的细胞进行了全蛋白质组的定量分析,发现除了XL01126外还有一个脱靶蛋白PDE6D,作者根据已有的PDE6D的PROTAC分子推测XL01126与其warhead的相似性可能是导致脱靶效应产生的原因。
 
  生物活性
 
  体外研究
 
  XL01126 (300 nM;4 h)通过与E3泛素连接酶配体VHL和靶蛋白LRRK2形成正合作三元配合物,表现出较强的降解性能。
 
  XL01126 (10,30,100 nM;24 h)增加永生化小鼠胚胎成纤维细胞的自噬。
 
  Xl01126 (10 μm;90分钟)Caco-2细胞显示高通透性。
 
  Xl01126 (10 μm;0-60最小;每15分钟间隔梯度)在小鼠血浆、肝微粒体和肝细胞中表现出很高的稳定性。
 
  XL01126体外药动学
 
  MCE尚未独立证实这些方法的准确性。仅供参考。
 
  Western Blot分析
 
  细胞系:g2019s LRRK2 MEFs(小鼠胚胎成纤维细胞)
 
  浓度:300 nM
 
  潜伏期:4小时
 
  结果:LRRK2 pSer935、Rab10 pThr73降低。

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