DNA 编码化合物库合成与筛选

　　DNA 编码化合物库（DNA Encoded compound Library，DEL）技术作为新颖、强大的苗头化合物发现引擎，可快速从几千万至数十亿分子中，遴选出结构新颖、具有潜在成药性的化合物，大大缩短药物研究周期，降低研发成本。在 DEL 库中，每一个分子砌块（Building Block）都由一段已知唯一的 DNA 序列进行标记，通过 DNA 兼容反应和组合化学模式，历经数个循环即可获得上亿 DEL 分子。数十亿化合物可以混合在一管中筛选，最终通过高通量测序技术，解码 DEL 分子的专属 DNA 标签，快速获得针对靶点的苗头化合物信息。

　　图1. DEL 库的构建和筛选

 

　　DNA 编码化合物库构建、合成

 

　　分子砌块是 DEL 库设计、合成的基础。基于 50000 余种高质量、结构多样的分子砌块， MCE 优中择优，剔除 DNA 嵌入剂、含 N-卤代、重金属等的“不良”化学结构，保留骨架独特、结构新颖、官能团多样、化学空间覆盖范围广的化合物。结合 MCE 自主开发的数百种 DNA 兼容性化学反应，最终构建出化学空间多样、结构新颖、包含数十亿化合物的 DEL 库。

　　图2. DEL 库的构建

 

　　DEL 库规格

 

　　3 个量级：

 

　　DEL A Kit：20 个 DEL 库，3 亿个 DEL 分子，1 管集合

 

　　DEL B Kit：50 个 DEL 库，10 亿个 DEL 分子，1 管集合

 

　　DEL T Kit：68 个 DEL 库，20 亿个 DEL 分子，1 管集合

 

　　Mini DEL 库：

 

　　DEL C Kit 共价库：5 个 DEL 库，0.03 亿个 DEL 分子，1 管集合

 

　　DEL D Kit 环肽库：5 个 DEL 库，0.08 亿个 DEL 分子，1 管集合

 

　　DEL E Kit 常规库：5 个 DEL 库，1.9 亿个 DEL 分子，1 管集合

 

　　DEL F Kit 常规库：5 个 DEL 库，1.09 亿个 DEL 分子，1 管集合

 

　　DEL G Kit 常规库：5 个 DEL 库，1.13 亿个 DEL 分子，1 管集合

 

　　DEL H Kit 常规库：10 个 DEL 库，5.5 亿个 DEL 分子，1 管集合

 

　　2 种规格：

 

　　5 nmol、20 nmol

 

　　DEL 库优点

 

　　?68 个 DEL 库，数十亿 DEL 分子

 

　　化学结构新颖，化学空间覆盖范围广，具备类药分子特性

 

　　强大的合成能力

 

　　严格的质量控制、验证体系

 

　　完善的产品、数据管理系统

 

　　紧跟研究趋势，不断更新

 

　　DNA 编码化合物库定制服务

 

　　MCE 不仅可以提供一站式的 DEL 筛选服务，更有热门的光交联 DEL 库、共价 DEL库、环肽 DEL 库等 DEL 库供选择，同时可提供 DEL 库定制服务，根据具体化合物结构类型，快速的衍生合成出数以百计的 DEL 分子。MCE 拥有强大而专业的 DEL 合成团队，紧跟科学前沿开发了数百种 DNA 兼容的化合物反应。

 

　　DNA 编码化合物库筛选

 

　　相较于传统的高通量筛选，DEL 筛选可以一次性筛选数以亿计的化合物；大大节约靶蛋白的使用量；筛选周期大大缩短；筛选成本更加低廉。DEL 库的筛选策略基本流程是将 DEL 库与靶标进行孵育后，基于小分子-蛋白质的亲和结合作用力，经过不同的洗脱方式，除去非结合小分子，实现具有高亲和力的小分子配体的高倍富集，结合 PCR 扩增与下一代测序的技术，可根据小分子的 DNA 标签实现化合物信息的解码。

　　图3. DNA 编码化合物的筛选策略：固相筛选

 

　　DEL 库筛选流程

 

　　a.蛋白固载与孵育：将待筛选的靶蛋白预先固载，随后将固载的蛋白质与 DEL 库孵育。

 

　　b.洗杂：洗去不与蛋白结合或结合力弱的 DEL 分子。

 

　　c.洗脱：将与蛋白结合的 DEL 分子洗脱，实现高亲和力小分子的富集。

 

　　d.PCR 扩增与蛋白结合 DEL 分子的 DNA 标签。

 

　　e.高通量测序与数据分析：对扩增后的 DNA 标签进行下一代测序，根据 DEL 小分子的 DNA 标签实现化合物信息的解码。

 

　　DEL 库筛选优点

 

　　一站式服务：DEL 库合成与 DEL 库筛选

 

　　少量蛋白样本：约 100 μg 蛋白（具体根据蛋白分子量决定）

 

　　4-5 周交付结果

 

　　严格的数据隐私管理

 

　　专业的技术团队